今帰仁アグーはDNA解析でアジア系と確認された『在来豚アグー』同士の他、
アジア起源のDNAを持つ『アヨー』との交配から生まれます。
遺伝子資源、文化資源として原種により近くする関係上、
閉鎖育種を行なっているため、他品種との交配によって、
派生したグループを今帰仁アグーの農場に持ち込まない方針を取っています。